Antes de relatar a história da Igreja Presbiteriana de Alto Jequitibá, precisamos esclarecer a sua origem. Ela nasceu de colonizadores evangélicos alemães luteranos que se estabelecerem em Alto Jequitibá, em 1868. Eram eles: Guilherme Eller, sua esposa, Carlota, e o 1° filho, que juntamente com Cristiano Cesar, também imigrante alemão, começaram a pregar o Evangelho. A fertilidade da terra atraiu outras famílias de emigrantes: famílias Faria, Emmerich, Gripp, Verly Heringer, Sattler, Cesar, Dias, Loubach, Breder, Spamer, Storck, Caterink, Kleim e outras.
Vinte e oito anos após sua chegada, Guilherme Eller e família, juntamente com Cristiano Cesar, para manter a fé dos familiares e patrícios, procuraram trazer um pastor para agrupar as ovelhas que se dispersavam. Assim chegou a Alto Jequitibá, em julho de 1896, o pastor Salomão Luiz Ginsburg. Muitos tiveram oportunidade de ouvir a mensagem santa da fé pela primeira vez, através da voz de um ministro protestante. O pastor era homem culto, autor de belos hinos, alguns deles transcritos em nosso Hinário Presbiteriano.
Em julho de 1897, chegou a Alto Jequitibá o Dr. John Merry Kyle, médico e missionário presbiteriano norte-americano que aqui permaneceu até 1900.
É oportuno lembrar que o 1° Templo da Igreja Presbiteriana de Alto Jequitibá, denominado “Casa de Oração”, foi inaugurado no dia 15 de outubro de 1897, construído pelo Sr. Henrique Eller.
Em 4 de julho de 1901, chegou a Alto Jequitibá Matathias Gomes dos Santos, um jovem pastor que conquistou a admiração e a confiança de todos. Antes de ser ordenado, o licenciado realizou um trabalho intenso. Acompanhado de alguns irmãos jovens como Felipe Eller e João Leandro de Faria, visitava a todos os irmãos, orando com eles e anunciando a Palavra. Compareceu à reunião do Presbitério do Rio de Janeiro, onde foi ordenado em 24 de janeiro de 1902. Mediante a apresentação do seu relatório, os membros do Presbitério nomearam uma Comissão para organizar a Congregação de Alto Jequitibá em igreja. De volta a Alto Jequitibá, explicou à igreja as exigências para a organização e tomou todas as providências necessárias. A data marcada para a organização da igreja foi 9 de março de 1902. Aquele domingo foi um dia de festa espiritual, e de muita gratidão a Deus. O Rev. Álvaro Reis veio do Rio de Janeiro e fez tudo conforme as prescrições do Livro de Ordem. Após o culto, houve a eleição dos presbíteros Antônio Pedro de Carvalho e Cristiano Cesar; e dos diáconos João Leandro de Faria, Manoel Jorge Eller e Aniceto Ferreira Gomes. Assim nasceu uma Igreja forte com 105 membros maiores e 200 menores.